吳東東，博士，中國科學院昆明動物所副研究員，碩士生導師，長期從事分子進化和生物信息學研究，2012年榮獲中國科學院百篇優秀博士論文獎，2013年入選中國科學院青年創新促進會。他參與的“基因組多樣性與亞洲人群的演化”項目獲2013 年云南省自然科學獎特等獎，并入選2014年云南省十大科技進展；“動物適應性進化的分子機制”獲2013 年云南省自然科學獎一等獎。

教育及工作經歷：

2006-09--2011-01 中國科學院昆明動物研究所 博士

2002-09--2006-07 復旦大學，生命科學學院 學士

2011-01--今 中國科學院昆明動物研究所 副研究員

招生專業：

遺傳學

基因組學

生物信息學

招生方向：

群體遺傳學，分子進化，基因組進化，轉錄組進化

基因組進化

計算比較基因組學

研究方向：

長期從事分子進化和生物信息學研究。

承擔科研項目情況：

1、利用從頭合成起源新基因研究基因網絡的起源與適應性進，主持，國家級，2013-01--2016-12 

2、老年癡呆癥研究團隊，參與，院級級，2013-01--2016-12 

3、中國科學院青促會專項基金，主持，院級級，2013-01--2016-12 

科研成果：

資料更新中……

1、 Genomic Analyses Reveal Potential Independent Adaptation to High Altitude in Tibetan Chickens.，Molecular Biology and Evolution，2015，通訊作者

2、 Recent Positive Selection Drives the Expansion of a Schizophrenia Risk Nonsynonymous Variant at SLC39A8 in Europeans.，Schizophrenia Bulletin，2015，第2作者

3、 Integrative analysis of young genes, positively selected genes and lncRNAs in the development of Drosophila melanogaster.，BMC Evol Biol，2015，通訊作者

4、 Population variation revealed high-altitude adaptation of tibetan mastiffs.，Molecular Biology and Evolution，2014，通訊作者

5、 Out of pollen hypothesis for origin of new genes in flowering plants: study from Arabidopsis thaliana.，Genome Biol Evol，2014，第1作者

6、 Domestication of the dog from the wolf was promoted by enhanced excitatory synaptic plasticity: a hypothesis.，Genome Biol Evol，2014，通訊作者

7、 Molecular evolution in the CREB1 signal pathway and a rare haplotype in CREB1 with genetic predisposition to schizophrenia.，J Psychiatr Res.，2014，第2作者

8、 Evolution and function of de novo originated genes，Molecular Phylogenetics and Evolution，2013，第1作者

9、 Artificial Selection on Brain-Expressed Genes during the Domestication of Dog.，Molecular Biology and Evolution， 2013,30(8):1867-76.，通訊作者

10、 Rapid Evolution of the Mammalian HILS1 Gene and the Nuclear Condensation Process during Mammalian Spermiogenesis，Journal of Genetics and Genomics ，2013，通訊作者 

11、 Evidence of recent natural selection on the Southeast Asian deletion (--(SEA)) causing α-thalassemia in South China.，BMC Evolutionary Biology ，2013，第2作者

12、 Positive selection on the osteoarthritis-risk and decreased-height associated variants at the GDF5 gene in East Asians，PLoS one，2012，第1作者

13、 The origin and evolution of variable number tandem repeat of CLEC4M gene in the global human population.，PLoS one ，2012，第3作者

14、 Positive selection on the gene RNASEL: correlation between patterns of evolution and function.，Molecular Biology and Evolution ，2012, 29(10): 3161-3168.，通訊作者 

15、 Correlated evolution among six gene families in Drosophila revealed by parallel change of gene numbers.，Genome Biology and Evolution，2011，第1作者

16、 Different level of population differentiation among human genes，BMC Evolutionary Biology ，2011，第1作者

17、 De novo origin of human protein-coding genes，PLoS Genetics，2011, 7(11): e1002379.，第1作者

18、 Multi-locus analysis reveals a different pattern of genetic diversity for mitochondrial and nuclear DNA between wild and domestic pigs in East Asia，PLoS one ，2011，第2作者

19、 Eukaryotic origin of a metabolic pathway in virus by horizontal gene transfer，Genomics，2011，第1作者
 
       20、褪黑激素通路基因多態性與日照時間的關聯研究 季林丹; 徐進; 吳東東; 謝思達; 鄧亮生; 張亞平 中國的遺傳學研究——遺傳學進步推動中國西部經濟與社會發展——2011年中國遺傳學會大會論文摘要匯編 2011-08-09

21、 Association of disease-predisposition polymorphisms of the melatonin receptors and sunshine duration in the global human populations.，Journal of Pineal Research，2010，第3作者

22、 Positive selection drives population differentiation in the skeletal genes in modern humans，Human Molecular Genetics，2010, 19(12): 2341-2346.第1作者

23、 Evidence for positive selection on the Osteogenin (BMP3) gene in human populations.，PLoS one，2010，第1作者  

24、 A profound role for the expansion of trypsin-like serine protease family in the evolution of hematophagy in mosquito.，Molecular Biology and Evolution， 2009, 26(10): 2333-2341.第1作者

25、 Molecular evolution of the keratin associated protein gene family in mammals, role in the evolution of mammalian hair. ，BMC Evolutionary Biology ，2008，第1作者

26、 Intriguing balancing selection on the intron 5 region of LMBR1 in human population.，PLoS one ，2008，第2作者

26、 Positive Darwinian selection in human population: a review，Chinese Science Bulletin，2008，第1作者

榮譽獎勵：

1、基因組多樣性與亞洲人群的演化，二等獎，國家級，2015。

2、盧嘉錫人才獎，部委級，2014。

3、基因組多樣性與亞洲人群的演化，特等獎，省級，2013。

4、動物適應性進化的分子機制，一等獎，省級，2013。

5、中國科學院百篇優秀博士論文獎，院級級，2012。

中國科學院昆明動物所吳東東博士，長期從事分子進化和生物信息學研究，他利用比較基因組學和群體基因組學方法，探討適應性進化機制，通過對這些分子適應性進化實例的闡述，總結出在基因組時代利用分子進化學方法研究適應性進化的研究思路、基本策略，在基因組時代背景下，基于這些大規模基因組數據，利用各種生物信息學和進化基因組學方法探討物種適應性進化的遺傳基礎。

1．物種間宏進化研究

在物種間宏進化的大時間尺度上，發現了60個對人類大腦進化有重要影響的從頭合成起源新基因，該成果于2011年發表在PLoS Genetics上(2011, 7(11):e1002379)。PLoS Genetics當期以perspective的形式報道了此項工作，認為其對進一步認識從頭合成起源的進化方式及人類進化遺傳機制具有重要的啟示意義，Scientific American雜志亦對其作了專題報道。由于該工作在新基因認識方面的重要影響，吳東東博士受邀為進化學領域的重要雜志Molecular Phylogenetics and Evolution撰寫綜述。

2．物種內微進化研究

在物種內微進化的時間尺度上，發現定向選擇在“形態、行為、生理”等三大性狀的進化過程中發揮了重要作用，對理解定向選擇對群體適應性進化的影響有重要意義，為揭示微進化模式提供了有價值的參考。具體地，發現人類骨骼基因在走出非洲之后，受達爾文正選擇驅動出現了不同方向的快速進化，以適應走出非洲后面臨的各種新環境。該研究在中性選擇驅動骨骼形態進化的主流理論之外，補充了達爾文正選擇對人類骨骼系統快速微進化的重要作用，為詮釋人類進化等古老命題提供了新的視野。在家養動物方面，發現大腦偏好表達基因在家犬馴化過程中發生了快速進化，很可能由此促成了家犬社會化行為的轉變，為行為等復雜性狀的研究提供了新的思路。該研究于2013年發表在Molecular Biology and Evolution (2013, 30:1867-1876) 后，被The New York Times報道。進一步，在地方家犬藏獒中鑒定了12個與低氧適應相關的基因，包括已在藏族人群適應進化研究中發現的基因EPAS1，揭示了人類和家犬在共享環境下的趨同進化，對深入探討家養動物快速適應極端環境的遺傳機制有重要參考價值，為保護藏獒種質資源提供了重要信息。該工作于2014年發表在Molecular Biology and Evolution上(2014, 31: 1200-1205)，該雜志以news形式報道了此工作，Sciencedaily亦做了專題報道。

專家簡介

吳東東，博士，中國科學院昆明動物所副研究員，碩士生導師，長期從事分子進化和生物信息學研究，2012年榮獲中國科學院百篇優秀博士論文獎，2013年入選中國科學院青年創新促進會。他參與的“基因組多樣性與亞洲人群的演化”項目獲2013 年云南省自然科學獎特等獎，并入選2014年云南省十大科技進展；“動物適應性進化的分子機制”獲2013 年云南省自然科學獎一等獎。