光壽紅，中國科學技術大學生命科學院教授、博士生導師，中組部"青年**計劃"首批入選者，中國科學院"**計劃"入選者。長期從事遺傳學和分子生物學相關研究，于2011年建立中國科學技術大學分子遺傳學實驗室。

教育及工作經歷：

1996年，在中國科學技術大學生物系獲得學士學位。

1996-1999年，師從中國科大施蘊渝院士進行多肽的溶液構象研究，并獲得碩士學位。

1999-2004年，在美國威斯康星大學癌癥研究所師從Janet Mertz教授，研究真核生物中病毒起源的無內含子RNA的表達和調控機制，并獲得博士學位。

2005-2010年，作為博士后在威斯康星大學遺傳系Scott Kennedy助理教授實驗室，從事模式生物中小干擾RNA的功能和調控機理的研究。進一步研究小干擾RNA的功能和調控機制。 

主講課程：

資料更新中……

培養研究生情況：

資料更新中……

招聘情況：

一、博士后，助理研究員

1.近年獲博士學位（助理研究員可為碩士學位），有志從事科學研究；

2.擁有良好的分子生物學、細胞生物學、發育生物學或醫學等相關專業背景；

3.在SCI刊物上至少發表過一篇第一作者論文；

4.富有獨立工作能力、責任心和協作精神；

5.思想開放, 樂于學習和接受新事物，懂得為前途而打拼。

二、特任副教授，特任副研究員

1.博士學位并有不少于兩年的相關生物博士后研究經驗；

2.擁有以下1-2項深入的研究經驗并有一定建樹：分子生物學、細胞生物學、遺傳學。

3.在SCI刊物上發表過多篇篇較高水平第一作者論文、有獨立撰寫學術論文和申請經費能力；

4.具有獨立領導研究生開展子課題研究的能力。

5.提供2位或以上同行專家詳細聯系方式。

受聘者將獲得與課題相關的基礎和研究訓練，相對獨立地承擔相關的科研工作，協助指導研究生，申請科研經費。應聘者的申請材料嚴格保密。初審通過者將安排面試，面試時間另行通知。應聘者被正式錄用后，其工資等有關待遇按照學校相關政策制度執行。優秀者有額外補貼。本實驗室鼓勵并支持年輕人在科學上發展并逐漸獨立。 

此招聘長期有效。請應聘者將個人簡歷和個人計劃通過電子郵件發送至:sguang@@@ustc.edu.cn

研究方向：

長期從事遺傳學和分子生物學相關研究。

（1）真核細胞中RNA的表達與加工的調節；

（2）真核生物中轉錄調節機制；

（3）非編碼RNA的表達與調節機制；

（4）模式生物的遺傳與發育；

(5) 基因編輯和染色體操縱的新技術和新方法。

承擔科研項目情況：

承擔973和基金委課題，同時獲中組部青年**計劃和中科院**計劃資助。

申請過兩個國家自然科學基金的面上項目：一個是研究非編碼核糖核酸在生物體中的作用機制，另一個是非編碼核糖核酸造成錯靶效應的機制。

本實驗室是在模式生物秀麗線蟲里進一步研究小RNA 和RNA干擾對干細胞發育和分化的功能及調節機制。具體而言，包括干細胞發育和分化過程中核RNA干擾途徑的內在功能，內源性小RNA的產生，以及RNA干擾的錯靶現象的機理。這項研究不僅對理解小RNA和干細胞的基礎生物學關系有重要意義，而且有助于更好地將小RNA和干細胞應用于研究和臨床治療的原因和機理。

1. 核RNA干擾通路的內在功能。在干細胞的發育和分化過程中，小RNA介導的基因表達調控是非常重要的，然而，其具體作用機制還不清楚。我們的初步研究表明，NRDE介導的小RNA核干擾途徑對秀麗線蟲干細胞的發育和分化是非常必要的。因此，要進一步了解核RNA干擾途徑在此過程中的生理功能，我們必須首先尋找核RNA干擾的內在靶位，以及整個核RNA干擾途徑的體系構造。

我們計劃使用基因組測序的方法來: (A) 確認nrde通路調控的基因序列；(B)確認NRDE-2和NRDE-3直接結合的前RNA的序列；(C) 確認NRDE-3結合的小RNA的序列。那些同時被這三種方法檢測到的基因才可能是核RNA干擾途徑的真正調控靶位。接下來我們計劃使用已經建立的遺傳和生化方法來進一步證實它們的表達受nrde通路的調控，以及研究這個調控是如何進行的。尋找和闡明這些核RNA的調控靶位可以讓我們更深入地研究nrde突變體里干細胞發育和分化缺陷。

2. 內源性小RNA的產生機理。動物體內小RNA的產生是一個精密調節的過程。異常的小RNA的表達往往會造成很多發育缺陷，例如癌癥和生殖不育以及干細胞定向分化和發育的缺陷。然而，迄今為止小RNA的產生機制并不清楚。我們已經建立了一個高效的遺傳篩選方法來研究在線蟲里的小RNA的產生機理：NRDE-3在細胞內的定位取決于它是否結合小RNA。當結合小RNA的時候，NRDE-3定位于細胞核，如果不結合小RNA的時候，NRDE-3定位于細胞質。通過對NRDE-3的定位研究，我們發現在一些突變體內，NRDE-3可以結合異常的小RNA，這些小RNA在野生型動物中往往很難被檢測到。我們推測這些突變體基因應該是小RNA表達的負調控基因。 我們計劃進一步克隆這些突變體基因以及它們調控的小RNA，從而了解其作用機制。這項研究必將有助于我們更好地了解小RNA的產生和調節機制，從而幫助我們更好地了解人類疾病的產生原因，特別是在干細胞的發育和分化過程中小RNA的內在功能。

3. RNA干擾的錯靶現象的機理。在將小RNA干擾技術運用于科學研究和疾病治療的過程中，RNA干擾的錯靶現象是研究人員都擔心和正在研究的關鍵問題。通常的觀念認為堿基的錯配是不可避免的，從而造成錯靶現象。然而，我們在研究中發現，一些RNA干擾的錯靶現象是主動地遺傳調控過程,而且這種錯靶現象與核RNA干擾途徑緊密相關。例如，錯靶的小RNA會優先結合NRDE-3，運輸到核里，誘導組蛋白３的９位賴氨酸(H3K9)的甲基化。

我們計劃進一步通過一系列的遺傳和生化的方法來研究RNA干擾的錯靶現象的機理。例如，(1)通過RNA免疫沉淀(RIP)的方法，辨別錯靶是起源于細胞質還是細胞核；(2)通過深度測序，闡明造成錯靶現象的小RNA是否在序列和結構上有特異性；(3)為了進一步研究錯靶現象的機理，我們已通過遺傳篩選的方法發現了多個抑制錯靶現象的突變體。通過克隆這些突變體基因，我們希望可以揭示錯靶現象的產生和作用機理，從而幫助我們更好地設計和運用基于小RNA干擾的藥物。

科研成果：

1.在包括Nature和Science在內的國際著名期刊上發表論文12篇（其中第一作者6篇），2篇論文被Faculty of 1000 Biology收錄并給予高度評價，曾獲得中國科學院院長獎及美國心臟協會博士后獎。

2.發現真核生物中無內含子的基因含有一些順式作用的RNA序列元素，它們可以和細胞內的特定蛋白相互結合，來提高該無內含子基因的前mRNA的穩定性，poly(A)聚腺苷酸化，以及從細胞核到細胞質的運輸；發現這些結合蛋白在正常情況下應用于含內含子的內源性基因的表達和加工。這項研究指出無內含子基因可以把細胞內正常基因表達和加工的所需因子轉為己用。此研究為治療病毒感染和癌癥提供了新的思路(NAR 2005; MCB 2005)。

3.確認了高等動物中存在著細胞核里的基因干擾現象；發現了非編碼RNA從細胞質轉運到細胞核的新途徑；發現了三個nrde基因；證明了非編碼的小RNA可以結合到正在被轉錄的轉錄子上；發現細胞核RNA干擾的機理可能是通過抑制RNA聚合酶II，抑制轉錄的延伸，從而造成轉錄的提前終止；發現高等動物中非編碼的小干擾RNA可以造成組蛋白的甲基化，而且這部分甲基化完全依賴于nrde基因；發展了模式生物整體上RNA-蛋白的免疫沉淀方法；發展了模式生物整體水平上轉錄活性的測量方法(Science, 2008；Nature, 2010)。

在包括Nature和Science在內的國際著名期刊上發表論文12篇（其中第一作者6篇），2篇論文被Faculty of 1000 Biology收錄并給予高度評價。

代表性英文論文：

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[2] Xiangyang Chen(#), Ke Wang(#), Farees Ud Din Mufti(#), Demin Xu, Chengming Zhu, Xinya Huang, Chenming Zeng, Qile Jin, Xiaona Huang, Yong-hong Yan, Meng-qiu Dong, Xuezhu Feng(*), Yunyu Shi(*), Scott Kennedy(*) & Shouhong Guang(*) (2024a) Germ granule compartments coordinate specialized small RNA production. Nature Communications, 15, 5799 (2024). https://doi.org/10.1038/s41467-024-50027-3 

 [3] Ling Liu, Yifan Wu, Ke Liu, Mengdan Zhu, Shouhong Guang, Fengsong Wang, Xing Liu, Xuebiao Yao, Jiajia He(*), Chuanhai Fu(*) (2024) The absence of the ribosomal protein Rpl2702 elicits the MAPK-mTOR signaling to modulate mitochondrial morphology and functions. Redox Biol. 2024 Apr 29:73:103174. doi: 10.1016/j.redox.2024.103174. 

[4]Wei I Jiang, Henry De Belly, Bingying Wang, Andrew Wong, Minseo Kim, Fiona Oh, Jason DeGeorge, Xinya Huang, Shouhong Guang, Orion D Weiner, Dengke K Ma (2024) Early-life stress triggers long-lasting organismal resilience and longevity via tetraspanin Science Advance 2024 Jan 26;10(4):eadj3880. doi: 10.1126/sciadv.adj3880. Epub 2024 Jan 24. 

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[10]Ting Xu，Shimiao Liao , Meng Huang, Chengming Zhu, Xiaona Huang, Qile Jin, Demin Xu, Chuanhai Fu, Xiangyang Chen(*), Xuezhu Feng(*) and Shouhong Guang(*) (2023) A ZTF-7/RPS-2 complex mediates the cold-warm response in C. elegans. PLoS Genetics, 2023 Feb 10;19(2):e1010628. doi: 10.1371/journal.pgen.1010628 

[11]Meng Huang(#), Minjie Hong(#), Chengming Zhu, Di Chen(*), Xiangyang Chen(*), Shouhong Guang(*), and Xuezhu Feng(*) (2022) H3K9me1/2 methylation limits the lifespan of daf-2 mutants in C. elegans. Elife. 2022 Sep 20;11:e74812. doi: 10.7554/eLife.74812. 

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[13]Xinhao Hou(#), Chengming Zhu, Mingjing Xu, Xiangyang Chen, Cheng Sun, Björn Nashana(*), Shouhong Guang(*), and Xuezhu Feng(*) (2022) The SNAPc complex mediates starvation-induced trans-splicing in C. elegans. Journal of Genetics and Genomics, 2022 Mar 10:S1673-8527(22)00076-5. doi: 10.1016/j.jgg.2022.02.024. 

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[16]Shimiao Liao(#), Xiangyang Chen(#), Ting Xu(#), Qile Jin, Zongxiu Xu, Demin Xu, Xufei Zhou, Chengming Zhu(*), Shouhong Guang(*) and Xuezhu Feng(*) （2021）Antisense ribosomal siRNAs inhibit RNA polymerase I-directed transcription in C. elegans Nucleic Acids Research Aug 7, 2021 https://doi.org/10.1093/nar/gkab662 

[17]Xinya Huang(#), Peng Cheng(#), Chenchun Weng, Zongxiu Xu, Chenming Zeng, Xiangyang Chen(*), Chengming Zhu(*), Shouhong Guang(*), and Xuezhu Feng(*) (2021) A chromodomain protein mediates heterochromatin-directed piRNA expression. PNAS, July 6, 2021 118 (27) e2103723118; https://doi.org/10.1073/pnas.2103723118 

[18]Chenming Zeng (#), Chenchun Weng (#), Xiaoyang Wang (#), Yong-Hong Yan (#), Wen-Jun Li, Demin Xu, Minjie Hong, Shanhui Liao, Meng-Qiu Dong, Xuezhu Feng (*), Chao Xu (*), and Shouhong Guang (*) (2019) Functional proteomics identifies a PICS complex required for piRNA maturation and chromosome segregation. Cell Reports Volume 27, ISSUE 12, P3561-3572.e3, June 18, 2019, DOI: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2019.05.076

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[22]Fei Xu (#), Xuezhu Feng (#), Xiangyang Chen, Chenchun Weng, Qi Yan, Ting Xu, Minjie Hong, and Shouhong Guang (*)（2018）A cytoplasmic Argonaute protein promotes the inheritance of RNAi. Cell Reports, 2018, 23(8): 2482-2494.

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[24]Fei Xu (#), Shouhong Guang (*), and Xuezhu Feng (*) (2018) Distinct nuclear and cytoplasmic machineries cooperatively promote the inheritance of RNAi in C. elegans. Biology of the Cell 2018 Aug 22. doi: 10.1111/boc.201800031  (review)

[25]Xufei Zhou (#), Xuezhu Feng (#), Hui Mao, Mu Li, Fei Xu, Kai Hu, and Shouhong Guang(*)  (2017) RdRP-synthesized antisense ribosomal siRNAs silence pre-rRNA via the nuclear RNAi pathway. Nature Structural & Molecular Biology 2017 Mar;24(3):258-269. doi: 10.1038/nsmb.3376. 

[26]Zhou X, Chen X, Wang Y, Feng X, Guang S. (2017) A new layer of rRNA regulation by small interference RNAs and the nuclear RNAi pathway. RNA Biol. 2017 Jun 22:0. doi: 10.1080/15476286.2017.1341034. (review)

[27]Li, Gaopeng; Wu, Xiaoli; Qian, Wenchang; Cai, Huayong; Sun, Xinbao; Zhang, Weijie; Tan, Sheng; Wu, Zhengsheng; Qian, Pengxu; Ding, Keshuo; Lu, Xuefei; Zhang, Xiao; Yan, Hong; Song, Haifeng; Guang, Shouhong; Wu, Qingfa; Lobie, Peter E.; Shan, Ge; Zhu, Tao*.CCAR1 5' UTR as a natural miRancer of miR-1254 overrides tamoxifen resistance.Cell Research, 2016, 26(6): 655-673. doi: 10.1038/cr.2016.32. 

[28]Xiangyang Chen, Xuezhu Feng (*) and Shouhong Guang (*) (2016) Targeted genome engineering in Caenorhabditis elegans. Cell & Bioscience 2016 6:60, DOI: 10.1186/s13578-016-0125-3  (review)   

[28]Mao, Hui; Zhu, Chengming; Zong, Dandan; Weng, Chenchun; Yang, Xiangwei; Huang, Hui; Liu, Dun; Feng, Xuezhu*; Guang, Shouhong*.The Nrde Pathway Mediates Small-RNA-Directed Histone H3 Lysine 27 Trimethylation in Caenorhabditis elegans.Current Biology, 2015, 25(18): 2398-2403.

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[29]Zhou X (#), Xu F (#), Mao H, Ji J, Yin M, Feng X (*), and Shouhong Guang (*) (2014) Nuclear RNAi Contributes to the Silencing of Off-Target Genes and Repetitive Sequences in Caenorhabditis elegans. Genetics 2014 May;197(1):121-132.

[30]Xiangyang Chen (#), Fei Xu (#), Chengming Zhu, Jiaojiao Ji, Xufei Zhou, Xuezhu Feng (*), and Shouhong Guang (*) (2014) Dual sgRNA-directed gene knockout using CRISPR/Cas9 technology in Caenorhabditis elegans. Scientific Reports 2014 Dec. 22;4:7581.

[31]Mao, Hui; Feng, Xue-zhu; Guang, Shou-hong*.Treating liver cancer with antibiotics?Acta Pharmacologica Sinica, 2013, 34(8): 989-990.; doi: 10.1038/aps.2013.102.

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[44]Guang, S., Wu, J.H., Yu, T., Xia, Y.L., and Shi, Y. (1998) Solution structure of a fragment of the dimerization domain of DP-1 determined by 1H-nuclear magnetic resonance and distance geometry. Biochim. Biophys. Acta - Protein Structure and Molecular Enzymology 1429(1):18-28.

[45]Guang, S., Wu, J.H., Tao, L., Xia, Y.L., and Shi, Y. (1998) Solution structure of a fragment of the dimerization domain of E2F-1 determined by circular dichroism, 1H-nuclear magnetic resonance and distance geometry. Biochim. Biophys. Acta - Protein Structure and Molecular Enzymology 1388(1):111-122.

[46] Xiangyang Chen, Shouhong Guang, （2021） Genome manipulation using CRISPR/Cas9 technology in C. elegans, The 6th Chinese C. elegans Meeting, Workshop, Oct 17 

中文期刊論文：

[1]徐飛, 馮雪竹, Xiangyang Chen, Chenchun Weng, Qi Yan, Ting Xu, Minjie Hong, 光壽紅. 一個細胞質Argonaute蛋白介導RNA干擾的遺傳[J]. 科學新聞, 2019, (02): 128.

[2]陳向陽, 馮雪竹, 光壽紅*. 靶向基因編輯技術在秀麗隱桿線蟲中的應用[J]. 中國科學:生命科學, 2018, 48 (03): 266-277.

[3]馮雪竹, 光壽紅. 細胞核內小干擾RNA介導的表觀遺傳和基因表達調控[J]. 中國科學:生命科學, 2017, 47 (01): 59-68.

[4]Hui Mao, Chengming Zhu, Dandan Zong, Chenchun Weng, Xiangwei Yang, Hui Huang, Dun Liu, 馮雪竹, 光壽紅. 秀麗線蟲中小RNA通過細胞核RNA干擾通路介導組蛋白3賴氨酸27的三甲基化[J]. 科學新聞, 2016, (01): 109.

[5]馮雪竹, 光壽紅. 秀麗線蟲細胞核內小干擾RNA調控基因表達的機制研究[J]. 中國科學技術大學學報,2013， 43(11)100-105

[6]夏佑林,吳季輝,光壽紅,張海陽,梁山,施蘊渝. Proton NMR investigation of heme and surrounding proton in low-spin cyanide-ligated bacterial hemoglobin from Vitreoscilla[J]. Science in China(Series C:Life Sciences), 2000, (01): 57-67.

[7]夏佑林,吳季輝,光壽紅,劉琴,張海陽,梁山,施蘊渝. 低自旋氰配位紫色震顫菌血紅蛋白血紅素及其周圍質子的核磁共振研究[J]. 中國科學C輯:生命科學, 1999, (05): 475-483.

[8]夏佑林,吳季輝,光壽紅,劉琴,張海陽,粱山,施蘊渝. 核磁共振波譜方法在順磁金屬蛋白-紫色震顫菌血紅蛋白中的應用[J]. 生物物理學報, 1998, (03): 11-20.

[9]Farees ud din mufti & 光壽紅. (2016). Erroneous transcript can trigger generation of siRNA by recruiting RdRP in Caenorhabditis elegans. (eds.) 第九屆全國核糖核酸學術討論會論文集 (pp.23).

榮譽獎勵：

1.中組部青年**計劃”入選者。

2.中國科學院“**計劃”入選者。

3.獲中國科學院院長獎及美國心臟協會博士后獎。

學術交流：

主持過第三屆全國線蟲大會以及第八屆全國核糖核酸會議，也參加了全國非編碼核糖核酸的香山會議。

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中國科技大學Cell子刊發表RNA研究新成果

生物體內存在大量不編碼蛋白質的非編碼RNA，它們廣泛參與了關鍵性細胞功能的調控。近年來人們發現，非編碼RNA出現異常與許多重要的疾病有關，了解這些RNA有助于更好的理解和治療相關疾病。

小干擾RNA（siRNA）是一種廣為人知的非編碼RNA，能夠調控細胞核中的基因表達。siRNA介導的染色質修飾已經在植物和酵母中被廣泛研究，但科學家們對動物的這種染色質修飾還不夠了解。

中國科學技術大學的研究人員日前發現，Nrde（nuclear RNAi defective）通路介導了siRNA誘導的組蛋白甲基化。這一成果發表在九月十日的Current Biology雜志上，文章的通訊作者是中國科技大學的光壽紅（Shouhong Guang）教授和馮雪竹（Xuezhu Feng）博士。

線蟲的Nrde（nuclear RNAi defective）通路可以將siRNA從細胞質轉運到細胞核、調控轉錄延伸、誘導H3K9三甲基化和介導RNAi的跨代遺傳。研究人員發現，結合NRDE的內源22G RNA和外源RNAi都能通過Nrde通路誘導序列特異性的H3K27三甲基化，而且這種H3K27me3狀態可以遺傳好幾代。

此外，piRNA和WAGO-1相關的siRNA也能誘導H3K27甲基化。有趣的是CSR-1相關的內源siRNA不能觸發H3K27甲基化，但外源dsRNA能夠通過Nrde通路在CSR-1靶位點誘導H3K27甲基化。

進一步研究表明，H3K27三甲基化和H3K9三甲基化的遺傳學要求并不相同，K27甲基化需要mes-2，而K9甲基化需要set-25和met-2。去除mes-2會使細胞核出現RNAi缺陷。這些結果說明，在線蟲中dsRNA觸發的染色質修飾，是一種涉及Nrde通路的序列特異性應答。

作者簡介：

光壽紅 1996年在中國科學技術大學生物系獲得學士學位，1996-1999年師從中國科大施蘊渝院士進行多肽的溶液構象研究，并獲得碩士學位。1999-2004年，在美國威斯康星大學癌癥研究所師從Janet Mertz教授，研究真核生物中病毒起源的無內含子RNA的表達和調控機制，并獲得博士學位。2005-2010年，作為博士后在威斯康星大學遺傳系Scott Kennedy助理教授實驗室，從事模式生物中小干擾RNA的功能和調控機理的研究。進一步研究小干擾RNA的功能和調控機制。在包括Nature和Science在內的國際著名期刊上發表論文12篇（其中第一作者6篇），2篇論文被Faculty of 1000 Biology收錄并給予高度評價，曾獲得中國科學院院長獎及美國心臟協會博士后獎。中組部青年**計劃”入選者。

來源: 生物通 2015-9-15