|
|
宋任濤,男,1970年10月出生,江蘇省蘇州市人,博士,F(xiàn)任上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授、博士生導(dǎo)師,上海市能源作物育種及應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任。
教育及工作經(jīng)歷:
1992年7月本科畢業(yè)于華東化工學(xué)院(現(xiàn)華東理工大學(xué))生物化學(xué)專業(yè)。
1997年7月博士畢業(yè)于中國科學(xué)院上海植物生理研究所,植物分子遺傳國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,遺傳學(xué)專業(yè)。
1997年7月至2004年5月在美國新澤西州Rutgers大學(xué)Waksman研究所從事植物分子遺傳和植物基因組學(xué)博士后研究工作。
2004年6月至今上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授。
2005年12月起任上海市能源作物育種及應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任。
學(xué)術(shù)兼職:
1、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)“國家玉米改良中心”兼職教授;
2、農(nóng)業(yè)部“作物基因組學(xué)遺傳改良開放實(shí)驗(yàn)室”、北京市“作物遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室”學(xué)術(shù)委員會委員;
3、中國生化化學(xué)與分子生物學(xué)會理事;
4、上海市植物生理學(xué)會常務(wù)理事;
5、上海市植物學(xué)會理事。
主講課程:
“遺傳學(xué)”,“轉(zhuǎn)基因技術(shù)與安全”(新生研討課)。
培養(yǎng)研究生情況:
資料更新中……
研究方向:
主要從事植物分子遺傳學(xué)和植物基因組學(xué)方面的教學(xué)與研究。
1. 玉米分子遺傳學(xué)研究。主要針對玉米籽粒的蛋白品質(zhì)性狀,開展重要突變體的基因克隆和功能分析。重點(diǎn)針對玉米籽粒Opaque突變體(為主要影響籽粒蛋白含量的一類突變體),開展圖位克隆和功能分析。并在此基礎(chǔ)上開展對玉米主要儲藏蛋白的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制研究。
2. 玉米基因組學(xué)研究。功能基因組學(xué)研究:利用玉米Ac轉(zhuǎn)座子系統(tǒng),創(chuàng)建玉米功能基因組學(xué)研究的遺傳材料,并探索相應(yīng)的研究方法。比較基因組學(xué)研究:開展玉米重要染色體位點(diǎn)的比較基因組學(xué)研究,特別關(guān)注玉米關(guān)鍵性狀的馴化問題。
目前主要研究興趣:
1. 玉米籽粒的分子遺傳學(xué)研究。主要針對玉米籽粒的蛋白品質(zhì)性狀,開展重要突變體的基因克隆和功能分析。重點(diǎn)針對玉米籽粒Opaque突變體(主要影響籽粒蛋白含量),Shrunken突變體(主要影響籽粒淀粉)和Dek突變體(主要影響籽粒發(fā)育),開展新基因的圖位克隆和功能分析。
2. 玉米儲藏蛋白轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究。主要針對玉米最主要的儲藏蛋白-醇溶蛋白,開展新的轉(zhuǎn)錄因子克隆和功能鑒定研究,以及已知的主效轉(zhuǎn)錄因子(如Opaque2、PBF等)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)研究。
3. 玉米基因組學(xué)研究。比較基因組學(xué)研究:開展玉米重要染色體位點(diǎn)(如醇溶蛋白基因簇)的比較基因組學(xué)研究,特別關(guān)注玉米關(guān)鍵性狀的馴化問題。功能基因組學(xué)研究:利用玉米內(nèi)源轉(zhuǎn)座子系統(tǒng),創(chuàng)建新的突變體研究材料;嘗試和探索高效克隆新基因的思路和方法。
4. 玉米轉(zhuǎn)基因育種研究。利用實(shí)驗(yàn)室原創(chuàng)發(fā)現(xiàn)的功能基因,開展針對玉米養(yǎng)分高效利用和籽粒品質(zhì)改善的轉(zhuǎn)基因分子育種研究。
以往主要研究基礎(chǔ):
1. 開展了針對玉米重要性狀的分子遺傳學(xué)和基因組學(xué)研究,其中對玉米主要馴化基因tb1的馴化突變位點(diǎn)的研究發(fā)表在Cell Research(2011)。對玉米重要籽粒突變體Opaque7的圖位克隆研究發(fā)表在Genetics(2011),是國內(nèi)首個(gè)發(fā)表的玉米圖位克隆研究工作。構(gòu)建了國內(nèi)首個(gè)可用于大規(guī)模玉米功能基因組研究的玉米Ac轉(zhuǎn)座子突變系統(tǒng)(Genetica,2010)。
2. 系統(tǒng)開展了針對玉米主要儲藏蛋白(醇溶蛋白)的基因組學(xué)、比較基因組學(xué)和功能基因組學(xué)研究,相應(yīng)研究以第一作者發(fā)表了Genome Research (2001),Genome Research(2002),Plant Physiology(2002)和PNAS(2003);以通訊作者發(fā)表了Plant Mol Biology(2009),Plant Mol Biology(2010)和Genome(2010)。
3. 在玉米中最先嘗試了RNAi轉(zhuǎn)基因技術(shù),并用單個(gè)RNAi構(gòu)建沉默一個(gè)基因家族,以第二作者發(fā)表Genetics(2003);在玉米中嘗試了超大片段的遺傳轉(zhuǎn)化,也是首次完整轉(zhuǎn)化一個(gè)大型的簇狀基因家族(高梁22kD醇溶蛋白基因簇),以第一作者發(fā)表Nucleic Acids Research(2004)。實(shí)驗(yàn)室建有成熟的玉米轉(zhuǎn)基因技術(shù)平臺,承擔(dān)有轉(zhuǎn)基因育種國家重大專項(xiàng)任務(wù)。
4. 參與了國際水稻基因組計(jì)劃中第10號染色體的序列測定工作,具體負(fù)責(zé)了Rutgers大學(xué)分?jǐn)偟膮^(qū)段,是Science(2003)和Nature(2005)的共同作者,并因此得到美國農(nóng)業(yè)部頒發(fā)的獎勵。回國后還開展了對14個(gè)野生稻在Moc1位點(diǎn)的比較基因組學(xué)分析,以并列第一作者發(fā)表PNAS(2009)。
5. 開展了極端耐逆生物(鹽藻Dunaliella viridis和鹽芥Thellungiella halophila)的功能基因研究,報(bào)道了多個(gè)獨(dú)特功能基因的克隆和功能分析,以通訊作者發(fā)表Plant Molecular Biology等SCI論文10篇。
承擔(dān)科研項(xiàng)目情況:
承擔(dān)國家自然科學(xué)基金、國家“863”計(jì)劃、國家“973”計(jì)劃,以及國家轉(zhuǎn)基因重大專項(xiàng)等科研項(xiàng)目。
1. 國家自然科學(xué)基金:玉米19kda醇溶蛋白基因家族的表達(dá)分析和轉(zhuǎn)錄因子研究。
資料更新中……
科研成果:
1. “水稻第十號染色體的測序和分析”在2004年6月獲美國農(nóng)業(yè)部(USDA)的“Group Honor Award for Excellence”獎。
2. 煙草對重組TMV的一種新的過敏性反應(yīng)抗病機(jī)制 許政暟; 李平; 宋任濤; 李茫茫; 李蓉; 賀燕云; 濮佳; 金菲; 李莉; 陳媛媛【科技成果】上海大學(xué) 2009-03-15
1 | 專利名稱 | 發(fā)明人 | 申請人 | 來源數(shù)據(jù) | 申請日 | 公開日 |
1 | 用于檢測玉米Proline1基因的引物組及其應(yīng)用 | 王剛;秦洪利;王超;徐楠;王桂鳳;韓亮;宋任濤 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2015-05-18 | 2015-08-26 |
2 | 不動桿菌谷氨酰胺合成酶基因、其編碼蛋白及克隆方法 | 朱晨光;王欣珍;陸定;王偉;唐遠(yuǎn)平;梅冰;宋任濤 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2014-04-02 | 2014-08-06 |
3 | 玉米Opaque1基因的分子標(biāo)記及其應(yīng)用 | 王桂鳳;王芳;鐘鳴宇;王佳佳;王剛;宋任濤 ;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2013-12-24 | 2014-04-02 |
4 | 用于檢測玉米不透明表型突變體5512G的分子標(biāo)記及其應(yīng)用 | 宋任濤 ;吳悄;陳逸涵;王冠;朱杰;唐遠(yuǎn)平;梅冰 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2013-04-28 | 2013-09-04 |
5 | 節(jié)桿菌谷氨酰胺合成酶基因、其編碼蛋白及其克隆方法 | 朱晨光;王偉;沈春磊;李朝斌;俞頔;唐遠(yuǎn)平;梅冰;宋任濤 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2013-04-15 | 2013-07-17 |
6 | 乳球菌谷氨酰胺合成酶基因、其編碼蛋白及其克隆方法 | 朱晨光;沈春磊;王偉;邢瑩瑩;徐騰蛟;唐遠(yuǎn)平;梅冰;宋任濤 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2013-04-16 | 2013-07-17 |
7 | 微球菌谷氨酰胺合成酶基因、其編碼蛋白及其克隆方法 | 朱晨光;王佩佩;王偉;吳悄;沈春磊;唐遠(yuǎn)平;梅冰;宋任濤 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2013-04-16 | 2013-07-17 |
8 | 枯草芽孢桿菌谷氨酰胺合成酶基因、其編碼蛋白及其克隆方法 | 朱晨光;沈春磊;王偉;葉先敏;王珊珊;唐遠(yuǎn)平;梅冰;宋任濤 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2013-04-15 | 2013-07-10 |
9 | 鹽藻肌醇磷酸合酶基因、其編碼蛋白及其應(yīng)用 | 李平;孫文杰;李松;俞頔;王超;宋任濤 ;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2013-02-22 | 2013-06-12 |
10 | 快速克隆細(xì)菌谷氨酰胺合成酶基因的方法 | 朱晨光;宋任濤 ;王佩佩;沈春磊;唐遠(yuǎn)平;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2012-09-07 | 2012-11-21 |
11 | 對bZIP類轉(zhuǎn)錄因子具有調(diào)控作用的基因、其克隆方法及其應(yīng)用 | 宋任濤 ;張男;喬禎逸;梁錚;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2012-05-03 | 2012-09-05 |
12 | 用于分離和鑒定Ac/Ds轉(zhuǎn)座子側(cè)翼序列的特異性引物 | 王飛;李鵬飛;徐大彬;郭圣明;趙志偉;樊軍;宋任濤 ;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2012-05-24 | 2012-08-29 |
13 | 提高玉米種子活力和抗寒能力的方法 | 李平;高超;李蕓;王珊珊;宋任濤 ;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2012-04-09 | 2012-08-01 |
14 | 具有耐鹽功能的基因、其編碼蛋白及應(yīng)用 | 宋任濤 ;李松;孫文杰;王任;劉翔;李平;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2012-01-09 | 2012-07-18 |
15 | 高賴氨酸玉米Opaque7基因的分子標(biāo)記及其應(yīng)用 | 王剛;樊向瑜;王樹;詹紅蕊;孫鑫;王桂鳳;王飛;宋任濤 ;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2012-03-01 | 2012-07-18 |
16 | 具有谷氨酰胺合成酶功能的基因、其編碼蛋白及其克隆方法 | 宋任濤 ;范倩嵐;王維華;李兆穎;朱晨光;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2011-06-03 | 2011-11-23 |
17 | 谷氨酰胺合成酶基因、其編碼蛋白及其克隆方法 | 宋任濤 ;范倩嵐;屈武斐;孫曉亮;朱晨光;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2011-06-03 | 2011-11-23 |
18 | 一種具有天冬酰胺合成酶功能的基因、其編碼蛋白及其應(yīng)用 | 宋任濤 ;許政暟;范倩嵐 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2010-12-22 | 2011-07-13 |
19 | 玉米Opaque5基因的分子標(biāo)記及其應(yīng)用 | 宋任濤 ;陳超;劉虎;張曉維;王剛;王飛;王桂鳳;高強(qiáng) | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2010-06-04 | 2011-01-19 |
20 | 一種具有抗Cd2+和抗Cu2+功能的基因DvCRP1、其編碼蛋白及應(yīng)用 | 宋任濤 ;許政暟;孟祥宗 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2010-06-12 | 2010-12-22 |
21 | 具有抗Cd2+和抗Cu2+功能的基因DvCRP2、其編碼蛋白及應(yīng)用 | 宋任濤 ;許政暟;孟祥宗;余浣莎 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2010-06-12 | 2010-12-22 |
22 | 一種具有抗氧化功能的基因及其應(yīng)用 | 宋任濤 ;許政暟;袁慧娟;陳晗俊;孟祥宗 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2009-09-27 | 2010-04-14 |
23 | 與胡蘿卜素合成有關(guān)的合成酶基因、其編碼蛋白及其應(yīng)用 | 宋任濤 ;許政暟;宋婷;常沖;林鈺靚;孟祥宗 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2009-09-27 | 2010-03-17 |
24 | 一種具有抗氧化功能的基因、其編碼蛋白及應(yīng)用 | 宋任濤 ;許政暟;袁慧娟;段艷芳;唐遠(yuǎn)平;孟祥宗 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2009-09-27 | 2010-03-17 |
25 | 玉米基因Opaque1的分子標(biāo)記及其應(yīng)用 | 宋任濤 ;王桂鳳;林佃彬;王慧;張晶;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2009-06-26 | 2010-01-20 |
26 | 一種病毒誘導(dǎo)的基因沉默系統(tǒng)及其應(yīng)用 | 許政暟;李茫茫;賀燕云;金菲;李平;宋任濤 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2008-08-07 | 2009-04-29 |
27 | 用于古細(xì)菌多樣性分析的針對16S rRNA基因的引物 | 宋任濤 ;濮佳;胡啟雯;賀其其;李莉;馬中良;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2008-09-24 | 2009-02-18 |
28 | 玉米基因Opaque7的分子標(biāo)記及其應(yīng)用 | 宋任濤 ;王剛;徐建平;周梁良;劉清爽;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2008-08-07 | 2009-02-18 |
29 | 用于真細(xì)菌多樣性分析的針對16S rRNA基因的引物 | 宋任濤 ;濮佳;袁軼偉;孫振華;張蔭雷;馬中良;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2008-09-24 | 2009-02-18 |
30 | 復(fù)雜固態(tài)環(huán)境中微生物基因組DNA的提取方法 | 宋任濤 ;濮佳;張蔭雷;賀其其;袁軼偉;馬中良;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2008-08-07 | 2008-12-31 |
31 | 鈉磷轉(zhuǎn)運(yùn)體DvSPT2基因誘導(dǎo)型啟動子、其克隆方法及其應(yīng)用 | 許政暟;宋任濤 ;厲高慜;張文文;盧彬;孟祥宗;管禎瑋 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2008-07-01 | 2008-11-12 |
32 | 一種重組植物病毒的物理滅活方法 | 許政暟;宋任濤 ;李平;慈云青;朱廣文 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2007-05-24 | 2008-01-16 |
33 | 鹽藻中鈉磷共轉(zhuǎn)運(yùn)通道1;2基因、其編碼蛋白及其克隆方法 | 宋任濤 ;許政暟;管禎瑋;孟祥宗 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2007-05-24 | 2008-01-09 |
34 | 鹽藻26S蛋白酶體亞基RPT2基因的cDNA序列、其編碼蛋白及其全長基因序列和克隆方法 | 宋任濤 ;許政暟;孫曉斌;孟祥宗 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2007-05-24 | 2008-01-02 |
35 | 鹽藻26S蛋白酶體亞基RPN10基因的cDNA序列、其編碼蛋白及其全長基因序列和克隆方法 | 宋任濤 ;許政暟;孫曉斌;孟祥宗 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2007-05-24 | 2008-01-02 |
36 | 與玉米籽粒發(fā)育相關(guān)的bZIP轉(zhuǎn)錄因子、其編碼基因及其基因表達(dá) | 宋任濤 ;朱佳;馮玲娜;王剛;許政暟 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2007-05-24 | 2008-01-02 |
37 | 薏苡醇溶蛋白 α-coixin基因、其編碼蛋白以及應(yīng)用 | 宋任濤 ;許政暟;黃彬彬;王剛;孟祥宗 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2007-05-24 | 2008-01-02 |
38 | 一種重組植物病毒的化學(xué)滅活方法 | 許政暟;宋任濤 ;李平;朱廣文;慈云青 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2007-05-24 | 2008-01-02 |
39 | 杜氏鹽藻TPSP基因、其編碼蛋白及其克隆方法和植物轉(zhuǎn)化載體的構(gòu)建方法 | 許政暟;宋任濤 ;孟祥宗;羅塞凡;李啟云;董虹云;李杉 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2007-02-09 | 2007-09-12 |
40 | 鹽芥花時(shí)相關(guān)基因、編碼蛋白及其克隆方法和應(yīng)用 | 宋任濤 ;許政暟;李杉;方巧云 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2006-04-28 | 2007-05-09 |
41 | 鹽藻碳酸酐酶3基因DvCA3、其編碼蛋白及其克隆方法 | 宋任濤 ;許政暟;李杉;孫曉明;張文文 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2006-07-21 | 2007-03-14 |
42 | 在低鹽和高鹽滲透脅迫下鹽藻差異表達(dá)的標(biāo)簽、基因片段及其克隆方法 | 宋任濤 ;許政暟;張雨 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2006-07-21 | 2007-02-28 |
43 | 鹽藻NADP-甘油醛-3-磷酸脫氫酶基因克隆和蛋白表達(dá)方法 | 許政暟;李啟云;宋任濤 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2006-03-30 | 2007-01-31 |
44 | 一種提高植物耐鹽性能的方法 | 宋任濤 ;許政暟;趙雅瑞 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2006-05-26 | 2006-11-29 |
45 | 衣藻紅色熒光標(biāo)記蛋白基因CrmRFP、其合成方法及其真核表達(dá)載體的構(gòu)建方法 | 宋任濤 ;許政暟;薛芳 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2006-04-28 | 2006-10-11 |
46 | 受高鹽誘導(dǎo)的鹽藻基因片段和鈉/磷共轉(zhuǎn)運(yùn)通道基因 | 許政暟;李啟云;高孝舒;孫煜;張慶琪;宋任濤 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2005-10-31 | 2006-10-04 |
47 | SARS病毒抗原S6-1的高特異性抗體的快速制備方法 | 許政暟;宋任濤 ;許寅琦 | 上海大學(xué) | 中國專利 | 2005-06-09 | 2005-11-23 |
在Science,Nature,PNAS,Genome Research等專業(yè)期刊上發(fā)表SCI論文50余篇,SCI引用超過2300次。
發(fā)表英文論文:
1. Wang G, Wang F, Zhang X, Zhong M, Zhang J, Lin D, Tang Y, Xu Z and Song R* (2012) Opaque1 encodes a Myosin XI motor protein that is required for endoplasmic reticulum motility and protein body formation in maize endosperm. Plant Cell2012 Aug 28 [Epub ahead of print] (In Brief: Maize opaque1 and protein body formation. Plant Cell 2012 Aug 21 [Epub ahead of print])
2. Zhang N, Qiao Z, Liang Z, Mei B, Xu Z and Song R* (2012) Zea mays taxilin protein negatively regulates Opaque-2 transcriptional activity by causing a change in its sub-cellular distribution. PLoS One 7(8):e43822.
3. Wang G, Xu J, Tang Y, Zhou L, Wang F, Xu Z and Song R* (2011) Molecular characterization of a genomic interval with highly uneven recombination distribution on maize chromosome 10L. Genetica 139: 1109-1118
4. Wang G, Sun X, Wang G, Wang F, Gao Q, Sun X, Tang Y, Chang C, Lai J, Zhu L, Xu Z and Song R* (2011) Opaque7 encodes an Acyl Activating Enzyme-lie protein that affects storage protein synthesis in maize endosperm. Genetics 189(4): 1281-1295
5. Zhou L, Zhang J, Yan J and Song R* (2011) Two transposable element insertions are causative mutations for the major domestication gene teosinte branched 1 in modern maize. Cell Research 21: 1267-1270.
6. Wang G, Wang G, Zhang X, Wang F and Song R* (2011) Isolation of high quality RNA from cereal seeds containing high level of starch. Phytochem Anal. (DOI 10.1002/pca.1337)
7. Zhu C, Xu Z and Song R* (2011) The endoglucanase from Bacillus subtilis BEC-1 bears halo tolerant, acidophilic and dithiothreitol stimulated enzyme activity. World J Microbiol Biotechnol (DOI 10.1007/s11274- 011- 0767-6)
8. Yuan H, Meng X, Gao Q, Qu W, Xu T, Xu Z and Song R* (2011) The characterization of two peroxiredoxin genes in Dunaliella viridis privides insights into antioxidative response to salt stress. Plant Cell Rep 30 (8): 1503-1512.
9. Song T, Gao Q, Xu Z and Song R* (2011) The cloning and characterization of two ammonium transporters in the salt-resistant green alga Dunaliella viridis. Mol Bio Rep 38 (7): 4797-4804.
10. Meng X, Xu Z and Song R* (2011) Molecular cloning and characterization of a vacuolar H+-pyrophosphatase from Dunaliella viridis. Mol Bio Rep 38(5): 3375-3382.
11. Zhang N, Wang F, Meng X, Luo S, Li Q, Dong H, Xu Z and Song R* (2011) Molecular cloning and characterization of a trehalose-6-phosphate synthase/phosphatase from Dunaliella viridis. Mol Bio Rep 38(4): 2241-2248.
12. Zhu C, Zhang J, Tang Y, Xu Z and Song R* (2011) Diversity of methanogenic archaea in a biogas reactor fed with swine faces as the mono-substrate by mcrA analysis. Microbiol Res 166: 27-35.
13. Li M, Li P, Song R and Xu Z (2010)An induced hypersensitive-like response limits expression of foreign peptides via a recombinant TMV-based vector in a susceptible tobacco. PLoS One 5(11): e15087.
14. Wang F, Li Z, Fan J, Li P, Hu W, Wang G, Xu Z and Song R* (2010) An Ac transposon system based on maize chromosome 4S for isolating long-distance-transposed Ac tags in the maize genome. Genetica 138: 1261-1270.
15. Zhou L, Huang B, Meng X, Wang G, Wang F, Xu Z and Song R* (2010) The amplification and evolution of orthologous 22-kD α-prolamin tandemly arrayed genes in coix, sorghum and maize genomes. Plant Mol Bio 74(6): 631-643.
16. Meng X, Huang B, Zhou L, He Y, Chen Q, Yuan Y, Xu Z and Song R* (2010) Construction of a Coix BAC library and isolation of the 22 kDa α-coixin gene cluster. Genome 53: 667-674.
17. Sun X, Meng X, Xu Z, Song R* (2010) Expression of the 26S proteasome subunit RPN10 is upregulated by salt stress in Dunaliella viridis. J Plant Physiol 167: 1003-1008.
18. Wang GF, Wang H, Zhu J, Zhang J, Zhang X, Wang F, Tang Y, Mei B, Xu Z andSong R* (2010) An expression analysis of 57 transcription factors derived from ESTs of developing seeds in Maize (Zea mays). Plant Cell Rep 29: 545-559.
19. Yan Q, Zhao M, Miao H, Ruan W and Song R (2010) Couple of the hydrogen and polyhyroxyalkanoates (PHA) production through anaerobic digestion from Taihu blue algae. Bioresource Technology 101: 4508-4512.
20. Han Y, Wang G, Liu Z, Liu J, Yue W, Song R, Zhang X and Jin W (2010) Divergence in centromere structure distinguishes related genomes in Coix lacryma-jobi and its wild relative. Chromosoma 119: 89-98.
21. He Y, Meng X, Fan Q, Sun X, Xu Z and Song R* (2009) Cloning and characterization of two novel chloroplastic glycerol-3-phosphate dehydrogenases from Dunaliella viridis. Plant Mol Bio 71: 193-205.
22. Feng L, Zhu J, Wang G, Tang Y, Chen H, Jin W, Wang F, Mei B, Xu Z and Song R* (2009) Expressional profiling study revealed unique expressional patterns and dramatic expressional divergence of maize α-zein super gene family. Plant Mol Bio 69:649-659.
23. Lu F, Ammiraju JS, Sanyal A, Zhang S, Song R, Chen J, Li G, Sui Y, Song X, Cheng Z, de Oliveira AC, Bennetzen JL, Jackson SA, Wing RA, Chen M. (2009) Comparative sequence analysis of MONOCULM1-orthologous regions in 14 Oryza genomes. Proc Natl Acad Sci USA. 106(6): 2071-6. (Co-first Author)
24. Guan Z, Meng X, Sun Z, Xu Z and Song R* (2008) Characterization of duplicated Dunaliella viridis SPT1 genes provides insights into early gene divergence after duplication. Gene 423(1):36-42.
25. Fang Q, Liu J, Xu Z and Song R* (2008) Cloning and characterization of a flowering time gene from Thellungiella halophila. Acta Biochim Biophys Sin. 40(8):747-53.
26. Guan Y, Chen Q, Pan J, Li Z, He H, Wu A, Song R and Cai R (2008) Construction of a BAC library from cucumber (Cucumis sativus L.) and identification of linkage group specific clones. Progress in Natural Science 18(2): 143-147.
27. Li Q, Jiang L, Li M, Li P, Zhang Q, Song R and Xu Z (2007) Morphology and stability changes of recombinant TMV particles caused by a cysteine residue in the foreign peptide fused to the coat protein. J Virol Methods 140(1-2):212-217.
28. Sun X, Tang Y, Meng X, Zhang W, Li S, Deng Z, Xu Z and Song R* (2006) Sequencing and analysis of a genomic fragment provides an insight into the Dunaliella viridis genomic sequence. Acta Biochim Biophys Sin. 38(11): 812-820.
29. Fang Q, Xu Z and Song R* (2006) Cloning, characterization and genetic engineering of FLC homologue in Thellungiella halophila. Biochem Biophys Res Commun. 347: 707-714.
30. Lu Q, Xu Z and Song R* (2006) OsFY, a Homolog of AtFY, Encodes a Protein that can Interact with OsFCA-g in Rice (Oryza sativa L.) Acta Biochim Biophys Sin. 38(7): 492–499.
31. Li Q, Li M, Jiang L, Zhang Q, Song R and Xu Z (2006) TMV recominants encoding fused foreign transmembrane domains to the CP subunit caused local necrotic response to susceptible tobacco. Virology 384: 253-259.
32. Li Q, Gao X, Sun Y, Zhang Q, Song R and Xu Z (2006) Isolation and characterization of a sodium-dependent phosphate transporter gene in Dunaliella viridis. Biochem Biophys Res Commun. 340(1): 95-104.
33. International Rice Genome Sequencing Project (2005) The map-based sequence of the rice genome. Nature 436: 793-800.
34. Song R, Segal G and Messing J (2004) Expression of sorghum 10-member kafirin gene cluster in maize endosperm. Nucleic Acid Research 32(22): e189
35. Segal G, Song R and Messing J (2003) A new opaque variant of maize by a single dominant RNA-interference-inducing transgene. Genetics 165: 387-397.
36. Song R and Messing J (2003) Gene expression of a gene family in maize based on noncollinear haplotypes. Proc Natl Acad Sci USA 100: 9055-9060.
37.The Rice Chromosome 10 Sequencing Consortium (2003) In-depth view of structure, activity, and evolution of rice chromosome 10. Science 300: 1566-1569.
38. Wu, L., Fan, J., Jiang, L., Wang, H., Song, R., Zhang, Q., Zhu, H., Li, N., Liu, Z. and Xu, Z. (2003) A specific cis-hairpin ribozyme facilitates infection of a TMV-based DNA vector in tobacco protoplasts. J Virol Methods 111:101-9.
39. Song R and Messing J (2002) Contiguous genomic DNA sequence comprising the 19-kDa-zein gene family from Zea mays. Plant Physiology 130: 1626-1635.
40. Song R, Llaca V and Messing J (2002) Mosaic organization of orthologous sequences in grass genomes. Genome Research 12: 1549-1555.
41. Park W, Li J, Song R, Messing J and Chen X (2002) CARPEL FACTORY, a Dicer homolog, and HEN1, a novel protein, act in microRNA metabolism. Current Biology 12: 1484-1495.
42. Song R, Llaca V, Linton E and Messing J (2001) Sequence, regulation and evolution of the maize 22 kDa a zein gene family. Genome Research 11: 1817-1825.43. Song, R., Li, J., Jin , H., Zhang, Q. and Xu, Z. (1997) Influence of substrate and ribozyme sequences on the functions of ribozyme. Acta Biochim Biophys Sin. 29: 61-68.
發(fā)表中文論文:
1 玉米轉(zhuǎn)錄因子ZmbHLH5的分離、序列分析及原核表達(dá) 優(yōu)先出版 王芳; 鐘鳴宇; 宋任濤; 許政暟; 王桂鳳 上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版) 2013/06
2 玉米粉質(zhì)胚乳突變體的研究進(jìn)展 姚東升; 宋任濤 自然雜志 2013/02
3 利用與su1緊密連鎖的Ac轉(zhuǎn)座子構(gòu)建玉米插入突變體庫 樊軍; 李鵬飛; 宋任濤; 王飛 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院/上海市能源作物育種及應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 【期刊】玉米科學(xué) 2012-08-15
4 Cupriavidus metallidurans CH34中2個(gè)苯酚降解基因簇的篩選與功能鑒定 李莉; 張俊亞; 唐遠(yuǎn)平; 宋任濤; 朱晨光 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院上海市能源作物育種及應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 【期刊】上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版) 2012-08-30
5 大豆細(xì)胞質(zhì)雄性不育系配套保持系線粒體基因組BAC文庫的構(gòu)建 費(fèi)曉艷; 趙洪錕; 劉曉東; 宋任濤; 李啟云; 董英山 吉林大學(xué)植物科學(xué)學(xué)院; 吉林省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物中心; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 【期刊】大豆科學(xué) 2011-06-25
6 Cupriavidus necator JMP134細(xì)菌人工染色體基因組文庫的構(gòu)建與鑒定 張俊亞; 宋任濤; 許政暟; 朱晨光 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院上海市能源作物育種及應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 【期刊】上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版) 2011-10-30
7 藍(lán)藻與污泥混合厭氧發(fā)酵產(chǎn)沼氣的初步研究 胡萍; 嚴(yán)群; 宋任濤; 阮文權(quán) 江南大學(xué)環(huán)境與土木工程學(xué)院; 江南大學(xué)工業(yè)生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 【期刊】環(huán)境工程學(xué)報(bào) 2009-03-05
8 含纖維素酶細(xì)菌的篩選及其纖維素酶生物學(xué)性質(zhì)的研究 馬中良; 李莉; 張陽奕; 宋任濤; 許政暟 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院上海市能源作物育種及應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 【期刊】藥物生物技術(shù) 2009-02-15
9 酪蛋白激酶2的亞基結(jié)構(gòu)與生理功能 段艷芳; 宋任濤; 王飛 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院上海市能源作物培育與應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 【期刊】生命的化學(xué) 2009-02-15
10 產(chǎn)甲烷古菌 朱晨光; 許政暟; 宋任濤 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院上海市能源作物育種及應(yīng)用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 【期刊】生命的化學(xué) 2009-02-15
11 黃瓜(Cucumis sativus L.)BAC文庫的構(gòu)建及連鎖群特異克隆的分離 關(guān)媛; 陳琪; 潘俊松; 李征; 何歡樂; 吳愛忠; 宋任濤; 蔡潤 上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院 上海 【期刊】自然科學(xué)進(jìn)展 2008-02-15
12 TMV重組外殼蛋白Sc1754CP的原核表達(dá)和多克隆抗體制備 李蓉; 宋任濤; 許政暟; 李平 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 上海 【期刊】上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版) 2008-06-15
13 利用ITS序列對兩個(gè)鹽藻株的分子鑒定 王偉; 許政螘; 宋任濤 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 上海; 中科院上海植物生理生態(tài)研究所 【期刊】上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版) 2006-02-28
14 真核基因轉(zhuǎn)錄的分子機(jī)制——2006諾貝爾化學(xué)獎簡介 孟祥宗; 許政暟; 宋任濤 中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 博士研究生 【期刊】自然雜志 2006-12-30
15 鹽藻(Dunaliella viridis)細(xì)菌人工染色體文庫的構(gòu)建和鑒定 孟祥宗; 楊曉武; 管禎瑋; 張男; 許政暟; 宋任濤 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 上海; 上海市能源作物培育及利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室; 中科院上海植物生理生態(tài)研究所 【期刊】上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版) 2007-02-28
16 抗稻瘟病水稻BAC文庫的構(gòu)建與鑒定 陳琪; 鄧一文; 黃彬彬; 孫曉明; 張文文; 王剛; 許政暟; 宋任濤 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 中科院上海植物生理生態(tài)研究所; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 上海; 上海市能源作物培育及利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 【期刊】上海大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版) 2007-06-15
17 外殼蛋白羧端序列缺失對煙草花葉病毒侵染性的影響 馬錚; 李巧麗; 宋任濤; 許政暟 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 中國科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院植物生理生態(tài)研究所; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 上海 【期刊】病毒學(xué)報(bào) 2005-07-20
18 外源ble基因在杜氏鹽藻中的瞬時(shí)表達(dá) 李子興; 孫煜; 劉志學(xué); 宋任濤; 許政暟 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 中科院植物生理生態(tài)研究所; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 上海; 中科院植物生理生態(tài)研究所 【期刊】實(shí)驗(yàn)生物學(xué)報(bào) 2005-10-15
19 一個(gè)雙價(jià)錘頭型核酶在體外對兩種不同植物病毒RNA的專一切割作用 宋任濤; 張慶琪; 李潔; 許政暟 植物生理學(xué)報(bào) 1999/02
20 核酶在大腸桿菌內(nèi)對煙草花葉病毒靶RNA的切割作用 張慶琪; 宋任濤; 許政(日豈) 實(shí)驗(yàn)生物學(xué)報(bào) 1998/04
21 底物和核酶的序列對核酶作用的影響 宋任濤; 李潔; 金海翎; 張慶琪; 許政皚 Acta Biochimica et Biophysica Sinica 1997/01
22 兩個(gè)缺陷型TMV粒子在煙草中的互補(bǔ)表達(dá) 金海翎; 張慶琪; 宋任濤; 許政愷 生物化學(xué)與生物物理學(xué)報(bào) 1996/04
23 雙價(jià)核酶對煙草花葉病毒的兩個(gè)靶序列的專一切割作用 李潔; 金海翎; 張慶琪; 宋任濤; 許政■ 生物工程學(xué)報(bào) 1995/01
榮譽(yù)獎勵:
1、2004年獲美國農(nóng)業(yè)部“杰出成就集體獎”,
2、2004年度上海市“曙光學(xué)者”,
3、2005年度上海市 “青年科技啟明星”,
4、2005年度上海市“浦江人才計(jì)劃”,
5、2006年度霍英東教育基金會資助者,
6、2006年度教育部“新世紀(jì)優(yōu)秀人才計(jì)劃”。
上海大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院宋任濤教授實(shí)驗(yàn)室最近在玉米蛋白品質(zhì)的研究上取得重要進(jìn)展,相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在植物學(xué)頂級學(xué)術(shù)期刊Plant Cell(五年平均影響因子10.65)。
玉米主要用作飼料,但是玉米在蛋白品質(zhì)上存在很大的缺陷,主要表現(xiàn)在缺乏賴氨酸等必需氨基酸。上世紀(jì)60年代,發(fā)現(xiàn)了一個(gè)重要的高賴氨酸突變體Opaque2,可以修復(fù)玉米蛋白品質(zhì)上的缺陷。然而Opaque2突變體還影響了很多其他的農(nóng)藝性狀,在實(shí)際的育種應(yīng)用中存在很多困難。雖然Opaque2基因在1987年被克隆,發(fā)現(xiàn)它編碼一個(gè)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子。但隨后的幾十年的研究并沒有搞清Opaque2具體調(diào)控哪些基因,以及其復(fù)雜表型性狀的分子本質(zhì)。
宋任濤課題組針對Opaque2突變體,開展了RNA測序和染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)測序,發(fā)現(xiàn)Opaque2突變后影響了約1600個(gè)基因的表達(dá);作為轉(zhuǎn)錄因子,Opaque2直接結(jié)合在約1100個(gè)基因序列上。進(jìn)一步分析表明有35個(gè)基因是Opaque2直接調(diào)控的靶標(biāo)基因,并通過功能分析確定了多個(gè)新的醇溶蛋白基因、轉(zhuǎn)錄因子、逆境相關(guān)基因等是新的靶標(biāo)基因。這一研究還給出了一個(gè)分層調(diào)控的模型,解釋了Opaque2突變造成的多效性的生物學(xué)效應(yīng)。這個(gè)工作是玉米蛋白品質(zhì)研究的一個(gè)重要進(jìn)展,已經(jīng)在線發(fā)表在植物學(xué)頂級期刊Plant Cell上(http://www.plantcell.org/content/early/2015/02/17/tpc.114.134858.full.pdf+html),并被編輯選為In Brief,撰寫了題為Clarifying the opaque: identification of direct targets of maize Opaque2的推薦介紹(http://www.plantcell.org/content/early/2015/02/24/tpc.15.00156.full.pdf+html)。
這個(gè)成果的第一作者分別是宋任濤教授的博士生李朝斌、喬禎逸同學(xué),以及青年教師祁巍巍博士。研究得到國家杰出青年科學(xué)基金、科技部973計(jì)劃等資助。這是宋任濤教授實(shí)驗(yàn)室自2012年以來,在玉米蛋白品質(zhì)研究上連續(xù)發(fā)表的第三篇Plant Cell論文。
一個(gè)“海歸”出國近7年、在國外的實(shí)驗(yàn)研究接近最佳狀態(tài)時(shí),受其昔日國內(nèi)導(dǎo)師的感召回到國內(nèi)。歸國4年里,幾乎在白手起家的狀態(tài)下建起了實(shí)驗(yàn)室,逐步帶起了一支研究隊(duì)伍……。在許多人看來,這會是又一個(gè)比較老套的海歸因親情感召回國創(chuàng)業(yè)發(fā)展的故事,但當(dāng)我?guī)滋烨霸谏虾4髮W(xué)新校區(qū)與這位主人公——該校生命科學(xué)學(xué)院教授、博士生導(dǎo)師宋任濤先生交流后,完全改變了這種想法。那天,小宋先帶著我參觀了他的實(shí)驗(yàn)室,這是一個(gè)主攻植物生長、變化規(guī)律,近年有分支延伸到作物能源方向的研究團(tuán)隊(duì)。小宋領(lǐng)我看了價(jià)格昂貴的測序分析儀,看了他們珍藏的種質(zhì)基因庫,他拿著其中一小瓶海藻種苗對我說,這是一種能在接近鹽鹵的高鹽狀態(tài)下生存的藻類,搞清其中的機(jī)理,對未來的抗鹽堿作物培育有相當(dāng)價(jià)值。接著他又領(lǐng)我看了他們在暖房里培育的擬南芥、煙草等模式植物……坦率地說,這些實(shí)驗(yàn)裝備、實(shí)驗(yàn)室條件,與我在張江園區(qū)和上海其他一些研究單位所看到的相比,遠(yuǎn)非上乘,甚至可說有點(diǎn)簡陋。但給我留下深刻印象的是參觀中宋先生對整個(gè)實(shí)驗(yàn)室、對每臺儀器、每間房舍的感情,那是只有為之付出過全部心血的人才會流露出的情感。一個(gè)非常自信的研究生坐定后一番......
資料更新中……
文章來源:《世界科學(xué)》2008年第04期
中國科技創(chuàng)新人物云平臺暨“互聯(lián)網(wǎng)+”科技創(chuàng)新人物開放共享平臺(簡稱:中國科技創(chuàng)新人物云平臺)免責(zé)聲明:
1、中國科技創(chuàng)新人物云平臺是:“互聯(lián)網(wǎng)+科技創(chuàng)新人物”的大型云平臺,平臺主要發(fā)揮互聯(lián)網(wǎng)在生產(chǎn)要素配置中的優(yōu)化和集成作用,將互聯(lián)網(wǎng)與科技創(chuàng)新人物的創(chuàng)新成果深度融合于經(jīng)濟(jì)社會各領(lǐng)域之中,提升實(shí)體經(jīng)濟(jì)的創(chuàng)新力和生產(chǎn)力,形成更廣泛的以互聯(lián)網(wǎng)為基礎(chǔ)設(shè)施和實(shí)現(xiàn)工具的經(jīng)濟(jì)發(fā)展新形態(tài),實(shí)現(xiàn)融合創(chuàng)新,為大眾創(chuàng)業(yè),萬眾創(chuàng)新提供智力支持,為產(chǎn)業(yè)智能化提供支撐,加快形成經(jīng)濟(jì)發(fā)展新動能,促進(jìn)國民經(jīng)濟(jì)提質(zhì)增效升級。
2、中國科技創(chuàng)新人物云平臺暨“互聯(lián)網(wǎng)+”科技創(chuàng)新人物開放共享平臺內(nèi)容來源于互聯(lián)網(wǎng),信息都是采用計(jì)算機(jī)手段與相關(guān)數(shù)據(jù)庫信息自動匹配提取數(shù)據(jù)生成,并不意味著贊同其觀點(diǎn)或證實(shí)其內(nèi)容的真實(shí)性,如果發(fā)現(xiàn)信息存在錯誤或者偏差,歡迎隨時(shí)與我們聯(lián)系,以便進(jìn)行更新完善。
3、如果您認(rèn)為本詞條還有待完善,請編輯詞條。
4、如果發(fā)現(xiàn)中國科技創(chuàng)新人物云平臺提供的內(nèi)容有誤或轉(zhuǎn)載稿涉及版權(quán)等問題,請及時(shí)向本站反饋,網(wǎng)站編輯部郵箱:kjcxac@126.com。
5、中國科技創(chuàng)新人物云平臺建設(shè)中盡最大努力保證數(shù)據(jù)的真實(shí)可靠,但由于一些信息難于確認(rèn)不可避免產(chǎn)生錯誤。因此,平臺信息僅供參考,對于使用平臺信息而引起的任何爭議,平臺概不承擔(dān)任何責(zé)任。