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胡躍清——統計遺傳學專家、復旦大學教授

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專家信息：

胡躍清——統計遺傳學專家，男，1965年出生，博士。現任復旦大學生物統計學研究所教授，博士生導師。

教育及工作經歷：

1981年至1988年就讀中山大學數學系獲理學學士學位和理學碩士學位。

1988年至2003年任東南大學助教、講師、副教授。

2003年至2007年就讀香港大學統計與精算學系獲哲學博士學位。

2007年至2009年任香港大學統計與精算學系助理教授。

2010年任復旦大學生物統計學研究所正高級PI。

社會任職：

資料更新中……

論文專著：

在American Journal of Epidemiology, Annals of Human Genetics, Biometrics, Forensic Science International, Genetic Epidemiology, Genetics, Heredity, Human Heredity, International Journal of Legal Medicine, Journal of Human Genetics, Journal of the Royal Statistical Society Series A, Scandinavian Journal of Statistics, Statistics in Medicine, Transfusion等國際著名刊物上發表科學論文10余篇，出版著作2部。

出版專著：

1 Wing-Kam Fung, Yue-Qing Hu (2008), Statistical DNA Forensics: Theory, Methods and Computation (262pp). John Wiley & Sons, Chichester, ISBN 978-0-470-06636-2.

2《概率論與數理統計》曹振華趙平 胡躍清 東南大學出版社 2002-8-1

發表英文論文：

1． Yue-Qing Hu, Wing-Kam Fung, Chi-Ting Yang (2004), On the Power of Excluding Relatives of the True Father from Paternity. In Doutrempuich C. and Morling N. (editors) Progress in Forensic Genetics 10. Elsevier Science, Amsterdam, pp. 514-516. 20th International Congress of the International-Society-for-Forensic-Genetics, Date: SEP 09-13, 2003 Arcachon FRANCE

2． Wing-Kam Fung, Yue-Qing Hu (2005), Deoxyribonucleic acid: statistical analysis. Encyclopedia of Forensic and Legal Medicine, Edited by Jason Payne-James, Roger W. Byard, Tracey S. Corey and Carol Henderson, Elsevier: Oxford, Copyright: 2005, ISBN 0-12-547970-0, Volume 2, pp. 184-189.

3． Yue-Qing Hu, Wing-Kam Fung (2005), Power of excluding relatives of the child from paternity using X-linked markers. Proceedings of the 5th IASC Asian Conference on Statistical Computing, pp. 57-60. December 15-17, 2005, Hong Kong.

4． Ji-Yuan Zhou, Wing K. Fung, Shili Lin, Yue-Qing Hu (2008), Single marker and haplotype analyses for detecting imprinting effects in families with both parents and families with one parent. Genetic Epidemiology, Vol. 32, Issue 7, pp. 724-724. 17th Annual Meeting of the International-Genetic-Epidemiology-Society, Date: SEP 14-16, 2008 St. Louis MO

5． Choy Yan Tsun, Hu Yue-Qing, Fung Wing-Kam (2009), Interpreting Y-chromosomal DNA Mixtures with the Presence of Paternal Relatives and Contributors from Different Ethnic Groups. Recent Advance in Statistics Applications and Related Areas --- Conference Proceedings of 2009 International Institute of Applied Statistics Studies, Qingdao, CHINA, Edited by Zhu Konglai and Henry Zhang, Aussino Academic Publishing House, Sydney, Australia, ISBN: 978-0-9806057-3-0, Volume II, pp.1876-1880.

6． Yuk-Ka Chung, Yue-Qing Hu, De-Gang Zhu, Wing K. Fung (2010), Evaluation of DNA mixtures accounting for sampling variability. Proceedings of COMPSTAT2010, 19th International Conference on Computational Statistics, Paris France, August 22-27, 2010 Keynote, Invited and Contributed Papers. Lechevallier, Yves; Saporta, Gilbert (Eds.) 1st Edition., 2011, 622 p., Softcover. ISBN: 978-3-7908-2603-6, pp.437-444. Due: October 15, 2010

7． Yue-Qing Hu, Wing K. Fung, Yan Tsun Choy (2011), Interpreting DNA Mixtures with Relatives of a Missing Suspect. Proceeding of 2011 International Conference on Remote Sensing, Environment and Transportation Engineering, Nanjing China, June 24-26, 2011. IEEE Catalog Number: CFP1104M-PRT, ISBN: 978-1-4244-9169-8, pp. 7649-7652

發表中文論文：

1 排除母系親屬父權概率的計算羅冬梅; 胡躍清 安徽工業大學數理學院; 東南大學數學系【期刊】數學理論與應用 2009-06-30

2 相關個體基因型聯合概率分布及在身份鑒定中的應用 胡躍清; 賈新剛東南大學數學系; 東南大學數學系江蘇南京; 江蘇南京【期刊】生物數學學報 2006-03-30

3 Bayes框架下DNA證據的量化研究朱德剛; 胡躍清 南京林業大學應用數學系; 東南大學數學系江蘇南京; 江蘇南京【期刊】生物數學學報 2008-03-15

4 母親基因型不完全時的親子鑒定 胡躍清; 麻清華東南大學數學系; 東南大學數學系南京【期刊】東南大學學報(自然科學版) 2004-10-20

5 參數正交化在評估數據影響中的應用 胡躍清 東南大學數學力學系【期刊】東南大學學報 1994-03-20

6 具有典則聯系函數的廣義線性模型的診斷 胡躍清 東南大學數學力學系【期刊】東南大學學報 1994-09-20

7 非線性回歸模型相關性和異方差性的檢驗韋博成; 胡躍清 東南大學數力系【期刊】工程數學學報 1994-11-30

8 基于K－L距離和信息距離的局部影響分析 胡躍清 東南大學數學力學系【期刊】東南大學學報 1995-01-20

9 基于Fisher信息陣的局部影響分析 胡躍清 東南大學數學力學系【期刊】東南大學學報 1995-05-20

10 回歸模型中的異方差性檢驗及分析 胡躍清 東南大學數學力學系【期刊】東南大學學報 1995-11-20

11 回歸模型中有影響變量的檢測標準及其靈敏度分析 胡躍清 東南大學數力系【期刊】應用數學 1996-07-25

12 回歸模型中擾動和自變量的影響度量 胡躍清 東南大學數學力學系【期刊】東南大學學報 1993-06-30

媒體報道：

胡躍清：為生命而奔走

說起生物統計學，很多人可能一頭霧水，不知道是研究什么的。“生物統計學是采用統計學的定量分析方法研究生命科學相關問題的一門交叉學科，目前已被廣泛應用于生命科學的各個領域中”，作為復旦大學生物統計學研究所正高級PI的胡躍清這樣解釋道。因此，也可以說，生物統計學是一門始終圍繞著生命而奔走的學科。

胡躍清多年從事統計遺傳學，統計法證學和統計診斷學的研究工作，在John Wiley & Sons出版著作“Statistical DNA Forensics: Theory, Methods and Computation”，在American Journal of Epidemiology, Annals of Human Genetics, Biometrics, Forensic Science International, Genetic Epidemiology, Genetics, Heredity, Human Heredity, International Journal of Legal Medicine, Journal of Human Genetics, Journal of the Royal Statistical Society Series A, Scandinavian Journal of Statistics, Statistics in Medicine, Transfusion等國際著名刊物上發表科學論文。

樹立科學理想走上研究道路

1981-1988年就讀中山大學數學系獲理學學士學位和理學碩士學位，2003-2007年就讀香港大學統計與精算學系獲哲學博士學位。1988-2003年任東南大學助教/講師/副教授，2007-2009年任香港大學統計與精算學系助理教授。從2010年，他開始擔任復旦大學生物統計學研究所正高級PI。胡躍清的求學道路走得很順暢，也走得相當精彩，令人艷羨。

談到自己的研究領域，胡躍清顯得有些興奮，一串串專業術語脫口而出：“我主要是利用和發展統計學方法和模型研究遺傳流行病的病理機制，親源效應檢測，復雜疾病基因定位，全基因組關聯分析，基因拷貝數變異和稀有變異相關問題研究，二代測序數據分析，DNA混合物的量化研究和相關統計軟件編制。”

科研道路上，胡躍清一直嚴格要求自己，立志創新。2005年，他憑借“DNA混合遺跡的法證研究及其分析軟件，以改善罪證確認可靠性”項目獲第九屆“挑戰杯”二等獎，該項目利用人體DNA紋印的獨一無二性進行個體身份的鑒定，建立和發展了一套完整的統計模型，在多種復雜情形下得出評價DNA混合遺跡的計算公式，編制相應的電腦分析軟件，程序運行效率高，界面友好，結果可直接生成分析報告。此套量化軟件已在香港、澳門、文萊、捷克斯洛伐克、比利時等國家和地區的法證實驗室得到應用。

承擔重要項目潛心致力研究

從2004年第一次在人類基因組中發現大規模的拷貝數變異開始，越來越多的科學家將注意力轉移到拷貝數變異這種新的重要的遺傳變異形式。并且，他們堅信，隨著測序技術的進一步發展以及在全球范圍內收集更多的樣本，將會發現更多的拷貝數變異。

許多科學家推測，拷貝數變異可能會通過影響基因的表達從而影響人類的多態性和對疾病的易感性。隨著對拷貝數變異研究的不斷深入，人們發現越來越多的復雜疾病都可能和拷貝數變異有關聯。另外也有報道稱，拷貝數變異會涉及到一些藥物代謝基因，從而影響患者的藥物代謝能力，這可以幫助我們理解為什么同樣的藥物用在不同的人身上會有不同的效果。因此，拷貝數的變異和很多復雜疾病都有著密切的關系,而關于拷貝數變異和復雜疾病之間的關聯分析研究是拷貝數變異研究中的一個重要組成部分。

基于拷貝數變異在遺傳學研究中的重要意義，胡躍清作為主持人承擔了國家自然科學基金面上項目“基于拷貝數變異的疾病易感基因定位中的統計方法研究”，該研究項目屬于統計遺傳學的研究范疇，人類復雜易感疾病基因的定位是一個非常熱門同時有異常困難的話題。

伴隨著人類基因組計劃的不斷深入和不斷完善，研究人員可以利用分析的數據也越來越多，當然其數量是海量級的。如何去挖掘其中對我們有用的信息是目前的研究重點之一。統計學在其中扮演著一個非常重要的角色。統計遺傳學則是統計學和遺傳學的廣度和深度結合。從已查閱到的文獻來看，國外的研究隊伍比較強大，而國內的研究隊伍實力相對較弱，人員相對較少。應該說，我國非常需要同時具備統計學和遺傳學的人才，此外還當然包括計算機編程的能力。已有的基于家系數據的研究結果限于雙親家庭，單個小孩，質量性狀值，數據的缺失跟個體的基因型無關，并且大多都是SNPs數據，這在很大程度上限制了研究結果的應用范圍。而胡躍清主持的這一項目則預期在一般家系基于基因拷貝數變異的關聯分析研究、遺傳印記基因的檢測、各種性狀基因的定位、當個體的生存狀態依賴于個體本身的基因型時的疾病易感性基因的定位、以及數據缺失的依賴性研究有所突破。目前已在基于家系數據的關于疾病和基因拷貝數之間的關聯分析研究方面取得了較好的進展。

作為主持人，胡躍清還承擔了上海市浦江人才計劃項目“檢測與癌癥相關聯的遺傳及環境因素的統計學方法研究”，該項目的特色之處在于：用統計學方法研究跟癌癥相關聯的影響因素，具體來說是（1）發展交叉熵來衡量病例組和對照組中稀有變異的分布的不同，取代傳統的只比較分布的平均值是否相同的做法，綜合考慮SNPs之間的依賴關系和不同的影響方向，檢測對癌癥有影響的特有變異模式。（2）盡管可以利用當下熱門的高通量二代測序技術來發現稀有變異，但由于測序成本的居高不下，要想在短時間內讓它走向大眾還不太現實。考慮到幾個常見變異就可以組成一個稀有單倍型變異，直接對GWAS時期花巨資構建的寶貴數據資源進行二次開采，發展相應的檢驗稀有單倍型的方法，極大降低研究成本。（3）目前處理高維數據的成熟方法還相當匱乏，人們還沒有合適的模型/工具來同時刻畫遺傳因素、環境因素、以及它們之間的交互作用的影響。發展logistic回歸模型，結合Bayesian LASSO的思想，做高維參數的假設經驗問題。(4) 為了極大的消除一些公共背景噪音對分析結果的影響，分層抽取對照組變得越來越流行。采用把分層變量看成協變量或基于分層變量的條件分布，高效檢驗出相關聯的稀有變異。同時還可以考慮對照組匹配抽樣和嵌套抽樣場合下的數據分析。

該項目亦有許多創新之處，諸如現有的大多數研究基因-環境因素相互作用的方法都是針對常見變異的，現有的定位稀有SNPs的關聯分析方法常常不考慮它們跟環境協變量之間的相互作用。該項目著眼于研究單倍型遺傳因素、環境因素以及它們之間的相互作用對癌癥的影響。該項目提出的方法可以充分利用豐富的GWAS資源來研究稀有變異。對稀有單倍型來說，這是一塊未曾開發的處女地，里面蘊含了極其有用的信息。與直接利用二代測序數據檢測稀有變異不同，對GWAS數據庫中的信息進行二次挖掘和利用是極具創新性的。同時，該項目首次考慮稀有單倍型和環境因素的互作，這在文獻中也是屬于首創。

此外，該項目將著重對GWAS時期構建的基因型和表性數據庫dbGaP這一寶貴資源進行二次開發，發展新穎的統計學方法，高效檢測出跟各種癌癥有關聯的遺傳因素（稀有SNPs和稀有單倍型）、環境因素以及它們之間的相互作用，評估稀有變異是否會增加患病的風險，以及在各種癌癥數據中的應用。從而為癌癥的基因療法提供非常可貴的統計學依據，為疾病的預防提供很好的理論依據。這將較客觀地評估和預測各種遺傳因素、環境因素（包括它們之間的互作）的患病風險，以及對揭示各種癌癥和其它復雜疾病的遺傳基礎做出重要貢獻。

2012年12月16日復旦大學成立了生物統計學和計算生物學系，我國生物統計學專業高等教育的歷史由此翻開了新的一頁。“這是我生命中的一件大事”，胡躍清動情地說。寄予這樣一個嶄新的高等教育平臺，培養出我國自己的生物統計學專業人才，吸引一批既懂統計學又懂生物學的年輕人加入到生物統計學研究隊伍，極大發展和提升我國的科學研究實力，在國際大舞臺上發表更多高水準的科學研究論文。　

文章來源：《科學中國人》2013-3-27

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